復旦大學附屬兒科醫(yī)院創(chuàng)建于1952年，系國家衛(wèi)計委預算管理單位、三級甲等醫(yī)院，是集醫(yī)、教、研、防為一體的綜合性兒童?？漆t(yī)院，全國兒科學重點學科、國家“211工程”和“985”工程建設單位，最早被國家授予兒科學碩士、博士學位授權(quán)點、臨床醫(yī)學博士后流動站。在中國醫(yī)學科學院發(fā)布的中國醫(yī)院科技競爭力排行榜、復旦大學發(fā)布的中國醫(yī)院最佳?？坡曌u排行榜和北京大學發(fā)布的中國醫(yī)院最佳臨床學科排行榜，復旦大學附屬兒科醫(yī)院兒科學均位居前列。醫(yī)院是國內(nèi)首個通過第五版JCI認證的兒童?？漆t(yī)院，于2016年11月通過HIMSS EMRAM 6級國際認證，于2017年1月獲批成為國家兒童醫(yī)學中心。連續(xù)八次榮膺上海市文明單位。

醫(yī)院宗旨：一切為了孩子。醫(yī)院使命：建樹醫(yī)學典范，呵護兒童健康。醫(yī)院定位：立足上海、服務全國、輻射亞洲。醫(yī)院愿景：亞洲一流的兒童醫(yī)學中心，兒科醫(yī)學教育向全國輻射的中心，中外兒科學術(shù)交流的重要橋梁。醫(yī)院院訓：團結(jié)、奮進、嚴謹、創(chuàng)新。醫(yī)院理念：尊重、平等、熱情、關(guān)愛。

在各級政府的大力支持和關(guān)心下，2008年2月29日，座落于閔行區(qū)萬源路399號的新醫(yī)院經(jīng)過將近4年的建設正式啟用，醫(yī)院主體從楓林路搬遷至新醫(yī)院，原址保留普通兒內(nèi)科門診服務功能，以滿足周邊地區(qū)病人的需求。新醫(yī)院占地153畝，現(xiàn)有建筑面積10萬平方米。截止2016年底，在職職工1686人，高級職稱專家157人，博士生導師32名，碩士生導師31名。

目前醫(yī)院開放床位800張，年門急診服務量逾225萬，出院病人突破4.2萬人次，住院手術(shù)2.8萬。醫(yī)院專業(yè)設置齊全，共設45個臨床專業(yè)醫(yī)技科室，擁有7個國家臨床重點專科，包括：新生兒、重癥醫(yī)學科、小兒消化科、中醫(yī)兒科、新生兒疾病重點實驗室、小兒外科、臨床護理。新生兒、外科、心血管、傳染病等專業(yè)曾先后被列為衛(wèi)生部臨床學科重點專業(yè)。新生兒科是上海市醫(yī)學重點學科，兒科學是上海市重中之重重點學科，小兒外科是上海市小兒外科疑難重癥臨床醫(yī)學中心，呼吸急救專業(yè)是上海市醫(yī)學領(lǐng)先專業(yè)。

醫(yī)院有2個省部級重點實驗室，分別為衛(wèi)生部新生兒疾病重點實驗室和上海市出生缺陷防治重點實驗室。科研實力雄厚，近10年來，承擔590項科研課題，縱向經(jīng)費3.0億元。包括國家重點研發(fā)計劃、國家自然科學基金重點課題、衛(wèi)生部行業(yè)專項、國家“863”、“973”、“十一五”、“十二五”科技支撐計劃等重要項目。在《The Lancet》、《Pediatrics》、《Journal of Pediatrics》和《Pediatric Research》等重要國際學術(shù)期刊發(fā)表SCI收錄論文893篇（近4年553篇），獲省部級以上獎項44項。出版《兒科學》、《小兒外科學》、《實用新生兒學》、《實用兒童保健學》、《實用新生兒小兒外科學》、《實用新生兒護理學》、《小兒感染病學》、《現(xiàn)代實用兒科學》等五十余部重要專著。主辦《中國兒科循證雜志》進入國家核心期刊，并與美國兒科學會協(xié)作主辦《Pediatrics中文版》。

復旦大學上海醫(yī)學院兒科學系設在兒科醫(yī)院，每年承擔13個專業(yè)1000余名醫(yī)學生的臨床教學與實習培養(yǎng)；每年在讀博士和碩士研究生200余名。醫(yī)院擁有國家兒科和兒外科住院醫(yī)師規(guī)范化培訓基地以及13個上海市兒科亞?？坪蛢和饪漆t(yī)師培訓基地，每年培養(yǎng)200余名住院醫(yī)師和?？漆t(yī)師。醫(yī)院每年培養(yǎng)長期進修學員300名，短期進修學員250名，至今已經(jīng)為全國各地培養(yǎng)進修醫(yī)生1萬余名。每年舉辦50-60期國家級繼續(xù)教育學習班。

醫(yī)院先后與美國、加拿大等國家的23家國際上知名的醫(yī)學機構(gòu)和國內(nèi)60多個單位建立密切協(xié)作關(guān)系。每年接待外賓講學、交流200余人次。多次主辦或承辦大型兒科國際學術(shù)會議，包括第43屆太平洋小兒外科年會、第16屆國際兒科腎臟病大會、IMFAR亞太區(qū)孤獨癥論壇以及上海新生兒論壇、兒科心血管國際研討會等等。

幾十年來，兒科人以“一切為了孩子”為宗旨，以“團結(jié)、奮進、嚴謹、創(chuàng)新”的院訓勉勵自己，貫穿“以人為本”的服務理念，構(gòu)建和諧穩(wěn)定的醫(yī)院文化，營造規(guī)范有序的工作氛圍，在國內(nèi)外享有盛譽。